文献类型： 中文期刊
作者： 孔啸兰 1 ; 李敏 2 ; 陈作志 2 ; 张俊 2 ; 许友伟 2 ; 江艳娥 2 ;
作者机构： 1.农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室
2.中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部外海渔业开发重点实验室
关键词： 竹?鱼;RAD-Seq;微卫星标记
期刊名称： 海洋渔业
ISSN： 1004-2490
年卷期： 2020 年 42 卷 006 期
页码： 650-658
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 通过对竹?鱼(Trachurus japonicus)基因组进行RAD-seq高通量测序,共获得19920条微卫星序列,其中2、3核苷酸重复微卫星序列最多(82.11%).选取89条2、3核苷酸重复的微卫星序列设计引物,经筛选后,共获得27个具有多态性的微卫星标记.利用一个竹?鱼群体对通过筛选的微卫星标记的种群遗传学特征进行评价.结果显示,27对引物扩增的序列中21个位点为2核苷酸重复,重复次数10~13次,6个位点为3核苷酸重复,重复次数为7~9次,等位基因数为3~19(平均9.8),表观杂合度(Ho)为0.344~0.938(平均0.654),期望杂合度(He)为0.336~0.880(平均0.729),多态信息含量(PIC)为0.318~0.882(平均0.707),表明开发的微卫星位点具有较高的遗传多样性."哈迪-温伯格"平衡(HWE)检测结果显示,25个标记等位基因频率符合HWE.连锁不平衡检测表明各位点间无连锁不平衡现象.研究开发的27个微卫星标记可为竹?鱼种群遗传学研究提供基础.
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