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五月龄翘嘴红鲌性腺组织小RNA转录谱的分析比较

文献类型： 中文期刊

作者： 曹访 1 ; 刘莉 1 ; 采克俊 1 ; 吴成龙 1 ; 周俊波 1 ;

作者机构： 1.湖州师范学院生命科学学院/浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室/中国水产科学研究院水生动物繁育与营养重点实验室;浙江省淡水水产研究所

关键词： 翘嘴红鲌;精巢;卵巢;miRNA;转录谱;分析;比较

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2020 年 48 卷 02 期

页码： 77-82

摘要： 采用转录组高通量测序方法,比较分析幼龄翘嘴红鲌精巢、卵巢组织中小RNA转录谱。结果显示,精巢、卵巢的小RNA分布的峰值分别为28、29 nt,与一般物种的22～24 nt有较大的差异;在小RNA库中,经比对注释的比例很低,分别为2.5%、2.1%。在比对注释的斑马鱼miRBase、斑马鱼ncRNA、piRNA、Rfam数据库中,精巢组织中被miRBase数据库注释的比例最高,为1.49%;而卵巢组织中被miRBase和piRNA数据库注释的比例接近,分别为0.94%和0.96%。比较表达量相对较高的共有miRNA分子,均是与胚胎发育相关的分子,且大多是精巢组织的表达量高于卵巢组织,这些miRNA分子在个体发育中可能具有重要意义。初步获得了翘嘴红鲌不同性腺组织的转录谱,为今后进一步分析小RNA在生殖发育中的调控作用奠定了基础。

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