文献类型： 中文期刊

作者： 王银月 ¹ ; 刘敏轩 ² ; 陆平 ² ; 乔治军 ³ ; 杨天育 ⁴ ; 李海 ⁵ ; 崔喜艳 ¹ ;

作者机构： 1.吉林农业大学生命科学学院

2.中国农业科学院作物科学研究所

3.山西省农业科学院农作物品种资源研究所

4.甘肃省农业科学院作物研究所

5.山西省农业科学院高寒区作物研究所

关键词： 黍稷;SSR标记;引物筛选;遗传图谱

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2014 年 04 期

页码： 32-38

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用SSR-PCR扩增技术,将实验室利用高通量测序与磁珠富集法结合开发得到的1 210对黍稷SSR引物进行筛选,筛选出在会宁大黄糜、陇糜8号、太原55号和会宁野糜子4个黍稷品种之间表现出条带清晰、多态性明显、重复性较好的引物;并通过提取DNA以及PCR过程中退火温度的简单优化来建立比较适宜的黍稷SSR分子标记反应体系。结果表明,在DNA提取过程中将ddH2O的量减少到100μL,增加65℃的水浴时间并增加4%β-巯基乙醇和DNA浓度等可以获得较高质量的DNA。利用优化好的反应体系从1 210对SSR引物中筛选出116对多态性较好的引物,占总数的9.59%,其中,群体一的2个亲本所特有的引物有36对,群体二的2个亲本中特有的引物有97对,2个群体共有的多态性引物有19对;对引物碱基结构分析发现,选用的1 210对引物中有1 173个双碱基重复SSR和36个三碱基重复SSR;筛选到的多态性引物中双碱基重复SSR有102个。三碱基重复SSR有14个。筛选出的多态性SSR标记能用于黍稷的遗传多样性和群体遗传结构研究。