文献类型： 中文期刊
作者： 王延召 1 ; 周波 1 ; 韩小花 1 ; 黄保 1 ; 鲁晓民 1 ; 程军玲 1 ; 王淑凤 2 ; 聂利红 3 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院粮食作物研究所
2.禹州市农业农村局
3.河南省农业科学院经济作物科学研究所
关键词： 玉米;GATA基因家族;全基因组鉴定;热胁迫;基因表达
期刊名称： 河南农业科学
ISSN： 1004-3268
年卷期： 2020 年 49 卷 011 期
页码： 19-25
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用生物信息学方法对玉米基因组中的GATA基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体分布、系统进化、基因结构、保守基序进行分析,并分析其在热胁迫前后的表达水平变化,以期为玉米GATA基因功能研究奠定基础.结果表明,在玉米基因组中共鉴定到37个GATA基因,它们不均匀地分布在10条染色体上,均含有CX2 CX18 CX2 C保守基序;进化树分析表明,玉米GATA基因家族可分为A、B、C、D 4组,分别包含21、10、4、2个基因,同一组内的基因具有相似的基因结构.热胁迫处理后,玉米GATA家族成员中表达上调的基因有9个,包含A组5个(Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135),B组2个(Zm00001d011771、Zm00001d034751),C组2个(Zm00001d036494、Zm00001d014656);下调的基因有2个,均属于B组(Zm00001d016361和Zm00001d009193).说明上调表达的这9个GATA基因在应答热胁迫过程中可能发挥重要作用.
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