文献类型： 中文期刊
作者： 王飞飞 1 ; 王夏雯 1 ; 金倩 1 ; 张智慧 1 ; 王信海 1 ;
作者机构： 1.宿迁市农业科学研究院
关键词： 稻虾共作;克氏原螯虾;组织;养殖环境;菌群结构;高通量测序
期刊名称： 青岛农业大学学报(自然科学版)
ISSN：
年卷期： 2021 年 002 期
页码： 91-97
摘要： 采用基于Illumina Hiseq的高通量测序技术,对稻虾共作模式下克氏原螯虾（procambarus clarkii）肠道、肝胰腺、鳃及其养殖池塘水体、底泥中菌群多样性进行了研究。测序结果显示,5个样品共获得有效序列393 519条,抽平后（48 659）聚类于7 223个分类操作单元（Operational Taxonomic Units,OTU）,归属于克氏原螯虾肠道、肝胰腺、鳃、养殖水体、池塘底泥样品的OTU个数分别为1 447、1 559、831、741和2 064,其中共有OTU 248个。Alpha多样性分析显示底泥、肝胰腺和肠道多样性指数较高,鳃和水体多样性指数较低。物种注释结果显示,克氏原螯虾肠道中优势细菌种类为厚壁菌门（42.16%）、变形菌门（13.78%）和柔膜菌门（13.07%）;肝胰腺优势细菌种类为厚壁菌门（54.52%）、变形菌门（10.69%）和放线菌门（10.6%）;鳃优势细菌种类为变形菌门（91.54%）、拟杆菌门（3.34%）和厚壁菌门（2.72%）;水体优势细菌种类为放线菌门（46.31%）、变形菌门（33.33%）和拟杆菌门（13.47%）;底泥优势细菌种类为变形菌门（40.18%）、绿弯菌门（18.14%）和厚壁菌门（9.88%）。此外,在属水平上各样品中的优势细菌种类差异较大。主坐标分析（Principal coordinates analysis,PCoA）分析发现底泥、肝胰腺、肠道微生物群落结构相似度较高,水体、鳃与其他样品微生物群落结构相似度较低。试验结果表明:克氏原螯虾肠道、肝胰腺、鳃与其养殖环境中菌群结构存在着一定的相关性,但各样品优势菌群差异较大。
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