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鹅呼肠孤病毒GRV1株分离鉴定及其σC基因特征性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郭东春 1 ; 张云 1 ; 刘明 1 ; 欧阳岁东 2 ; 胡奇林 2 ; 张序 3 ; 刘怀然 4 ;

作者机构: 1.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

3.哈尔滨市兽医卫生防疫站

4.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所实验动物中心

关键词: 鹅呼肠孤病毒;同源性;小核心蛋白(σC).

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2006 年 28 卷 03 期

页码: 257-260

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从患运动障碍的雏鹅肝脏和脾脏分离到一株鹅源呼肠孤病毒,该病毒经琼脂扩试验可与番鸭呼肠孤病毒(MuscovyDuckReovirus,MDRV)的抗血清发生交叉反应,推测其为呼肠孤病毒,命名为GRV1。参考GenBank禽呼肠孤病毒(AvianReovirus,ARV)和番鸭呼肠孤病毒小外壳蛋白(minorcoreprotein)σC蛋白基因序列设计合成了一对引物,病毒RNA经RT-PCR扩增,产物为810bp,与预期的目的片断大小一致,测序结果表明σC基因在280~1089区间是一个开放性阅读框架,编码269个氨基酸的蛋白,GC含量为49.88%,等电点为6.497,分子量为29.4Ku。核苷酸序列经DNAStar(6.0)软件分析,与法国番鸭呼肠孤病毒89026株核苷酸同源率为93.0%,与鸡呼肠孤病毒σC基因同源率仅为21%~25%,同源性分析表明鹅呼肠孤病毒与番鸭呼肠孤病毒可能来自同一祖先,建议将鹅呼肠孤病毒连同番鸭呼肠孤病毒归属为正呼肠孤病毒属第二个亚群中不同于禽和内尔森贝海湾呼肠病毒的独立基因群。由蛋白质分析软件Anthepro5.0和MultiCoil软件分析表明,抗原区多位于N末端,没有跨膜区,σC为三股螺旋结构,这是我国第一次在鹅体内分离到呼肠孤病毒,同时也是第一次在数据库中提供σC的序列。

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[1]一株雏鹅呼肠孤病毒的分离与鉴定. 陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,施少华,傅秋玲,张丹青,黄瑜. 2015

[2]香蕉枯萎病菌线粒体小亚基(mtSSU)rDNA的克隆及序列分析. 郑荔,兰成忠,姚锦爱,阮宏椿,陈福如. 2012

[3]禽多杀性巴氏杆菌C48-1株omp基因克隆及序列分析. 陈红梅,施少华,程龙飞,傅光华,彭春香,黄瑜. 2008

[4]鸡黄病毒CJD05株E基因克隆与序列分析. 王劭,陈仕龙,陈少莺,林锋强,朱小丽. 2011

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