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用RAPD及mtDNA D-loop区序列揭示长江下游长春鳊遗传多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 李建林 1 ; 唐永凯 1 ; 俞菊华 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室

关键词： 长春鳊;RAPD;线粒体DNA控制区;遗传多样性

期刊名称： 上海水产大学学报

ISSN： 1004-7271

年卷期： 2008 年 17 卷 02 期

页码： 145-151

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用RAPD和mtDNA D-1oop区序列对长江下游长春鳊群体的遗传多样性进行分析。从40个随机引物中筛选出扩增条带清晰的28个引物,对24尾采自长江下游常熟江段长春鳊的基因组DNA进行扩增,共检测到178个位点,扩增片段大小在0.2~2 kb之间,其中多态位点有83个,占46.63%;个体间最大的遗传距离为0.132 6,最小的遗传距离为0.047 6,平均遗传距离为0.088 5;群体的Shannon多样性指值为0.098 6。RAPD结果表明该长春鳊群体的遗传多样性处于中等水平。对其中8尾长春鳊mtDNA D-1oop区序列(938 bp)进行了分析,发现了8种单倍型,检测出17个多态性核苷酸变异位点,多态位点比例为1.81%,变异位点为15个转换,2个颠换;单倍型多态性(h)为1.000,核苷酸多态性(pi)为0.006 2,平均核苷酸差异数(K)为5.821,单倍型间平均遗传距离为0.006 3。结果说明长春鳊mtDNA D-1oop区在个体间的遗传差异较小。

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