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民猪NUMB基因克隆与组织表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘娣 1 ; 王鑫鑫 1 ; 别墅 1 ; 张冬杰 2 ; 汪亮 2 ; 李苓 1 ; 曹越 1 ;

作者机构: 1.东北农业大学动物科学技术学院

2.黑龙江省农业科学院畜牧研究所

关键词: 民猪;NUMB基因;反转录PCR;克隆;生物信息学

期刊名称: 东北农业大学学报

ISSN: 1005-9369

年卷期: 2016 年 47 卷 01 期

页码: 51-57

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 研究采用RT-PCR技术结合克隆测序方法,克隆出全长2 004 bp NUMB基因序列,其中包括1 782 bp开放读码框,该基因编码592个氨基酸。利用生物信息学分析软件对该基因氨基酸序列预测与分析发现:NUMB蛋白二级结构中,转角占很大比例,且蛋白亲水性较强,结构功能域分析发现该蛋白多肽链存在一个N端磷酸酪氨酸结构域(PTB),位于第37~162氨基酸之间。基于不同物种NUMB蛋白序列所构建分子进化树表明,猪与牛、骆驼亲缘关系最近,而与斑马鱼最远。在m RNA水平上,NUMB基因肺中表达量最高,大肠中表达量最低。

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