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谷子SiPRR73基因在不同光温组合条件下的可变剪切分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王晓蒙 1 ; 李剑峰 1 ; 刘辉 1 ; 王永芳 1 ; 张小梅 1 ; 王振山 1 ; 桑璐曼 1 ; 闫留延 1 ; 龚珂珂 1 ; 李兴杰 1 ; 董志平 1 ; 贾小平 1 ;

作者机构: 1.河南科技大学农学院;河北省农林科学院谷子研究所/国家谷子改良中心

关键词: 谷子;PRR73;光温互作;可变剪切

期刊名称: 江西农业大学学报

ISSN: 1000-2286

年卷期: 2023 年 45 卷 006 期

页码: 1324-1330

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]通过系统的可变剪切分析揭示SiPRR73参与谷子光温互作调控的可能机制.[方法]利用RT-PCR技术从"延谷11号"克隆生物钟基因SiPRR73,克隆低温(15℃)条件、自然条件、4个光温组合条件下的SiPRR73基因序列进行可变剪切分析.[结果]扩增片段经克隆、测序以及序列拼接后得到2928 bp的cDNA序列,包含2283 bp的CDS区域,编码760个氨基酸.可变剪切分析表明只有低温(15℃)和低温长日照(22℃、15 h光/9 h暗)条件下检测到的SiPRR73-1和SiPRR73-3剪切体具有完整的编码区,因而具有完整的REC和CCT结构域;自然条件和低温短日照(22℃、9 h光/15 h暗)条件检测到的SiPRR73-2、SiPRR73-4剪切体均缺失CCT结构域;高温(27℃)条件无论长日照还是短日照SiPRR73均形成缺失REC和CCT结构域的SiPRR73-5、SiPRR73-6两种剪切体.[结论]SiPRR73基因通过可变剪接的方式参与谷子的光温互作调节.

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