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糙皮侧耳发酵玉米秸秆转录组揭示木质素降解相关途径

文献类型： 中文期刊

作者： 马蕊 1 ; 赵飞 1 ; 范寰 1 ;

作者机构： 1.天津师范大学;天津市畜牧兽医研究所

关键词： 糙皮侧耳;木质素;转录组;差异基因;代谢途径

期刊名称： 饲料研究

ISSN： 1002-2813

年卷期： 2017 年 09 期

页码： 42-48

摘要： 木质素是影响生物质降解利用机制的重要组分,但其生物降解机制尚不清晰。利用白腐真菌糙皮侧耳菌株降解玉米秸秆过程中的基因表达变化,尝试挖掘木质素降解的关键生物代谢途径。通过发酵过程中5个木质素含量变化显著关键时间点的转录组测序发现,发酵过程中共有139个上调基因和308个下调基因。基因功能分类数据库(GO)功能分析结果表明,上调基因差异显著性较高的功能为囊泡运输、细胞定位、胞内定位、细胞过程、组蛋白甲基化、转移酶活性、异构酶活性和磷酸葡糖变位酶。基因产物在细胞中代谢途径数据库(KEGG)注释结果表明,上调基因差异显著性较高代谢通路为赖氨酸代谢、β-丙氨酸代谢、淀粉蔗糖代谢、半乳糖代谢和戊糖磷酸。13条与木质素降解直接有关的路径为苯甲酸代谢、二噁英代谢、酚代谢、多环芳香烃(PAH)代谢、氨基苯甲酸代谢、萘代谢、甲苯代谢、脂肪酸代谢、醚酯代谢、二甲苯代谢、碳代谢、过氧化物酶体和溶酶体。

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