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鳗鲡疱疹病毒FJ株ORF51基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李友娟 1 ; 葛均青 1 ; 林天龙 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院生物技术研究所

关键词： 鳗鲡疱疹病毒;ORF51基因;克隆测序;生物信息学分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2014 年 04 期

页码： 314-318

摘要： 为了解本课题组分离的鳗鲡疱疹病毒福建株(AngHV-FJ)ORF51的结构特征,扩繁了AngHV-FJ,提取其基因组DNA,经PCR扩增,获得ORF51基因,将其克隆至pMD19-T载体中,进行DNA测序,用生物信息学方法分析AngHV-FJ ORF51基因及其编码蛋白的结构和功能。结果显示,扩增到长约720bp的ORF51基因序列,其与GeneBank上鳗鲡疱疹病毒欧洲株(AngHV-1)ORF51基因的序列完全一致。该基因编码239个氨基酸;预测ORF51基因编码蛋白的分子量为26 107.1Da,等电点为7.66,是疏水性蛋白且偏碱性;有4个跨膜域;抗原表位预测显示抗原性较好;结构预测显示,存在1个N-糖基化位点、1个O-糖基化位点、10个磷酸化位点;亚细胞定位预测显示其主要存在于内质网。本研究为解析ORF51的功能及开展AngHV的基因工程疫苗研究奠定了基础。

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