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唐古特白刺叶片转录组测定和分析

文献类型: 中文期刊

作者: 徐君 1 ; 李刚 2 ; 史文君 2 ; 刘晓雯 3 ;

作者机构: 1.青海省农林科学院

2.青海省玛可河林业局

3.青海大学农林科学院

关键词: 唐古特白刺;转录组;代谢途径;代谢产物

期刊名称: 青海农林科技

ISSN: 1004-9967

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 1-8

摘要: 为了解白刺遗传水平的特征,本文以唐古特白刺叶片为材料,利用高通量测序技术进行转录组分析。基因注释结果显示,总共注释了28 614个Unigenes,七大数据库共同注释到的有3 176个。NR注释结果表明唐古特白刺叶片基因序列与甜橙的同源序列匹配度最高。GO数据库基因注释主要集中在细胞过程、代谢过程和结合与催化活性。KEGG数据库中基因在细胞过程分支中富集到了共316个,环境信息处理分支中富集到了250个,其中植物激素信号调节代谢途径在分支中注释到的基因最多,有223个,它在白刺干旱调节过程中发挥着重要作用,在新陈代谢分支中氨基酸代谢途径、苯丙烷类物质生物合成等途径中注释到的显著表达的基因较多,这与唐古特白刺的应激耐受性和其生境的恶劣环境有关。

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