文献类型： 中文期刊
作者： 张宇 1 ; 周佳伟 1 ; 吴俊静 1 ; 乔木 1 ; 徐忠 1 ; 李梓芃 1 ; 彭先文 1 ; 梅书棋 1 ;
作者机构： 1.动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室
关键词： 猪;总产仔数;产活仔数;健仔数;全基因组关联分析
期刊名称： 中国畜牧杂志
ISSN： 0258-7033
年卷期： 2022 年 58 卷 008 期
页码： 94-99
收录情况： 北大核心
摘要： 本研究利用全基因组关联分析(GWAS)挖掘与大白猪总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和健仔数(NHP)相关的候选基因.选择1100头大白猪为实验材料,通过提取耳尾组织样DNA并利用"中芯一号"芯片进行基因型分型,采用PLINK v1.9对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究.rMVP软件对每个SNP与性状做关联分析,确定出显著位点.结果表明:对于TNB性状共有3个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NBA性状共有4个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NHP分析得到18个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著.在上述显著SNPs附近共有23个候选基因,根据基因功能注释推测ESR1、ZP3、YWHAG、HSPB1、MDH2、PCCB是能够影响繁殖性状的重要候选基因.
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