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新疆石河子部分地区猪流行性腹泻病毒遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄新 1 ; 吴桐忠 1 ; 韩猛立 1 ; 张星星 1 ; 何延华 1 ; 钟发刚 1 ;

作者机构: 1.新疆农垦科学院/省部共建新疆绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室

关键词: 猪流行性腹泻病毒;遗传进化;S基因;ORF3基因;新疆石河子

期刊名称: 中国兽医杂志

ISSN: 0529-6005

年卷期: 2019 年 005 期

页码: 17-20

收录情况: 北大核心

摘要: 为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,从石河子的3个地区已确诊PED猪场采集病料,分别获得了3株PEDV S基因序列和ORF3基因序列,将其进行序列比对及遗传进化分析.根据3株S基因序列分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146株与韩国QIAP1401株(KX793713)序列相似性最高,达到97.4%和98.7%;XJ-SW株与广东GD-03 2012株(KP870115)序列相似性最高,达到98.5%.3个分离株与PEDV疫苗株AF353511(CV777)性序列相似性分别为94.5%、94.2%和94.1%.系统进化分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146与韩国的KPV1406(KM108353))、QIAP1401(KX793713))同为一群.XJ-SW株与广东GD/03/2012((KP870115))、GD/2011株(KP870115)同为一群;3株PEDV ORF3基因序列与疫苗株(CV777)序列比对多个位点存在突变,序列相似性较低.

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