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芒果精氨酸脱羧酶基因MiADC的克隆及表达分析（英文）

文献类型： 中文期刊

作者： 刘荣 1 ; 黄海 1 ; 韩树全 1 ; 范建新 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院亚热带作物研究所

关键词： 芒果;MiADC gene;RACE;生物信息学分析

期刊名称： Agricultural Science & Technology

ISSN： 1009-4229

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 9-16

摘要： 精氨酸脱羧酶(Arginine decarboxylase,ADC)在植物多胺生物合成中发挥着重要作用。为了研究精氨酸脱羧酶基因(ADC)在芒果中的结构与表达情况,试验采用RACE技术从芒果嫩叶中克隆获得芒果精氨酸脱羧酶基因MiADC,并以MiADC基因的cDNA序列为基础,采用qRT-PCR分析该基因的表达情况。序列分析结果显示:芒果MiADC基因全长3 089 bp,包括575 bp 5’-UTR,2 178bpORF,311bp3’-UTR和25bppoly(A),且无内含子。NCBI比对分析显示:该基因与枳(Poncirus trifoliate)精氨酸脱羧酶基因(HQ008237.1)的相似性最高,为78%;其预测蛋白同样与枳(Poncirus trifoliate)精氨酸脱羧酶(AEE99192.1)的相似性最高,为78%。系统发生树分析表明:芒果MiADC与枳(Poncirus trifoliate)的精氨酸脱羧酶处于同一进化枝上。表达分析显示:MiADC基因在根、茎、叶、花、幼果、成熟果组织中均有表达,且该基因的转录水平受低温处理的影响。因此,芒果MiADC基因可能是一个低温胁迫应答基因。

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