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青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 程亮 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院 植物保护研究所

关键词： 马铃薯Y病毒;cp基因;序列分析;最大似然法;青海

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2019 年 31 卷 011 期

页码： 1888-1895

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 马铃薯Y病毒(PVY)是危害我国马铃薯的主要病毒之一,其在自然条件下极易发生基因变异而产生株系分化现象.为揭示青海马铃薯Y病毒分离物cp基因的分子变异,利用RT-PCR方法扩增获得了16个马铃薯Y病毒分离物的cp基因序列,采用SDT、DANMAN、RDP和MEGA软件对其进行分子变异分析.序列一致率结果表明,16个分离物的核苷酸序列均为801个碱基,一致率为98.0% ~100%,编码267个氨基酸,一致率为94.8% ~100%.重组分析表明,16个分离物未发生基因重组.系统发育分析发现,11个分离物与PVYN-Wi株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVYN-Wi株系的亲缘关系最近,占被检出病毒分离物的68.7%;另外5个分离物与PVYO株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVYO株系亲缘关系最近;未发现PVYC株系、PVYN株系、PVYE株系和PVYNTN株系存在.

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