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编码区和非编码区SSR标记对水稻类群的比较研究

文献类型： 中文期刊

作者： 李宇歌 1 ; 罗文永 1 ; 李晓方 1 ; 刘志霞 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院水稻研究所广东省水稻育种新技术重点实验室暨农业部水稻遗传改良重点开放实验室

关键词： 编码区SSR;非编码区SSR;水稻;聚类分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2007 年 27 卷 11 期

页码： 2181-2187

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 设计14对水稻编码区SSR引物和选取已公布的非编码区SSR引物12对、编码区SSR引物3对,采用SSR技术,对29个标记在60个水稻材料中的多态性进行分析。结果表明,编码区SSR标记平均检测到3.59个多态性位点,多态信息量PIC(polymorphism information conten)在0.032～P0.853之间,平均值为0.447;非编码区SSR标记平均检测到3.92个多态性位点,PIC在0.063～P0.795之间,平均值为0.521。聚类分析显示,非编码区SSR标记能更加精确地区分来自不同地区的水稻类群,编码区SSR标记也具有良好的多态性,同样可以用于分析水稻的亲缘关系。

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