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茶树功能候选基因电子克隆的可行性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孔祥瑞 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院茶叶研究所

关键词： 茶树;电子克隆;咖啡碱合成酶基因;系统进化树

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2014 年 12 卷 02 期

页码： 332-337

收录情况： CSCD

摘要： 为验证电子克隆技术获取茶树功能候选基因的可行性,本研究以可可的咖啡碱合成酶基因BCS1为探针,对构建的茶树EST数据库进行本地BLAST检索,获得与BCS1具有高度同源性的茶树EST序列26条。将26条茶树EST序列经程序CAP(contig assembly program)拼接,得到2条含有独立ORF的EST簇(Contig),分别命名为基因TCSnew1和TCSnew2。将这2个基因与GenBank中由实验方法克隆得到的茶树咖啡机合成酶基因TCS的cDNA进行核酸序列、推导氨基酸序列比对,及构建系统发育树进行3个基因推导氨基酸序列间的同源性分析。结果发现,茶树远缘物种的兴趣序列作为探针用于电子克隆获取茶树功能候选基因与实验克隆技术相同,是一条可行的技术途径。

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