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魁蚶过氧化氢酶基因克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄永欢 1 ; 刘志鸿 1 ; 吴彪 1 ; 周丽青 1 ; 孙秀俊 1 ; 杨爱国 1 ; 李东明 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 魁蚶;过氧化氢酶;RACE;qRT-PCR

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2016 年 40 卷 06 期

页码: 856-866

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR和c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE)克隆出魁蚶过氧化氢酶(Sb CAT)基因c DNA全长序列,该基因全长为2181 bp,包括1431 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),96 bp的5'端非翻译区(UTR)和654 bp的3'-UTR。其中ORF编码477个氨基酸,预测分子量为54 ku,理论等电点为8.03。Sb CAT氨基酸序列与其他所选动物的氨基酸序列具有较高的相似性,其相似度为68%~96%,Sb CAT氨基酸具有CAT基因家族的特征性序列,包括CAT活性位点,1个亚铁血红素结合位点及3个催化位点残基。此外,Sb CAT还具有保守的亚铁血红素结合口袋与还原型辅酶Ⅱ(NADPH)结合位点。采用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测了Sb CAT的组织表达特征。结果显示,Sb CAT m RNA在所检测的6种组织中均有表达,在外套膜中表达量较高,在肝胰腺和红细胞中表达量较低。经鳗弧菌和金黄色葡萄球菌刺激后,鳗弧菌刺激组的外套膜表达量一直较低,其他组织均表现出先上升再下降的趋势。研究表明,Sb CAT可能在魁蚶免疫防御中发挥重要作用。

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