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绵羊母源基因TRIM28克隆、表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 罗健 1 ; 王立民 1 ; 张译元 1 ; 郭延华 1 ; 唐红 1 ; 周平 1 ; 刘守仁 1 ;

作者机构: 1.石河子大学动物科技学院;新疆农垦科学院/绵羊遗传改良与健康养殖省部共建国家重点实验室

关键词: TRIM28;Zfp57;母源基因;DNA甲基化;生物信息学

期刊名称: 石河子大学学报(自然科学版)

ISSN: 1007-7383

年卷期: 2017 年 02 期

页码: 139-145

摘要: 为了研究TRIM28基因在绵羊早期克隆胚胎发育过程中基因组去甲基化与重新甲基化及其维持的机制,探索母源关键基因在体细胞克隆效率中的作用,本研究通过提取中国美利奴细毛羊卵巢组织RNA,经反转录获得cDNA,利用特异性引物扩增TRIM28基因编码区序列,测序后采用生物信息学软件对编码区序列及氨基酸序列进行相关生物信息学分析和结构预测,进一步采用RT-PCR对绵羊不同组织中TRIM28表达量进行检测。结果显示:克隆获得了绵羊TRIM28基因编码区序列全长2441bp,编码811个氨基酸。生物信息学分析结果表明,不同物种TRIM28基因编码区核苷酸和氨基酸序列具有较高保守性。组织表达谱结果显示,TRIM28 mRNA在中国美利奴细毛羊肺脏、脾脏和卵巢中高丰度表达,且与Zfp57表达情况一致。结论:TRIM28基因结构和进化方面高度保守,推测其在不同组织中行使转录中介因子这一特定的生物学功能相关,TRIM8与ZFP57复合体在分化组织中对基因组甲基化的维持起着重要作用。

  • 相关文献

[1]TRIM28 regulates Igf2-H19 and Dlk1-Gtl2 imprinting by distinct mechanisms during sheep fibroblast proliferation. Luo, Jian,Zhang, Yiyuan,Guo, Yanhua,Tang, Hong,Wei, Haixia,Liu, Shouren,Wang, Xinhua,Wang, Limin,Zhou, Ping,Wei, Haixia,Liu, Shouren,Wang, Limin.

[2]绵羊MTNR1A基因SNPs筛选及生物信息学分析. 王明远,张宾,于刚,王雨曈,杨永林,余乾,赵宗胜,杨华. 2021

[3]绵羊FGF5基因编码蛋白的生物信息学分析. 刘伍限,贾斌,石国庆. 2011

[4]雷蒙德氏棉和亚洲棉Alfin-like PHD finger家族的生物信息学分析. 马盼盼,赵曾强,叶春秀,孙国清,谢宗铭. 2018

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