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基于高通量测序的福安刺葡萄基因组初步研究

文献类型： 中文期刊

作者： 陈婷 1 ; 周平 1 ; 刘鑫铭 1 ; 蔡盛华 1 ; 雷龑 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院果树研究所

关键词： 高通量测序;福安刺葡萄;基因组

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2017 年 32 卷 02 期

页码： 134-137

收录情况： 北大核心

摘要： 为进一步了解福建福安刺葡萄的遗传背景,寻找刺葡萄与欧亚种葡萄之间的遗传差异,本研究基于高通量测序技术展开对福安刺葡萄基因组的分析,共得到测序数据8.4Gb,鉴定出3 192 484处非冗余遗传差异。差异位点分布位置结果显示,30.34%的差异位于基因间区,3.67%的差异位于基因外显子区。通过对比葡萄参考基因组序列,共鉴定出刺葡萄基因组上存在1 863 237个同源SNP、1 244 590个异源SNP位点,表明本次测序所用的福安刺葡萄有可能是异源二倍体。

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