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剑尾鱼热应激蛋白HSP70 cDNA片段的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 万文菊 1 ; 王纪亭 2 ; 石存斌 1 ; 吴淑勤 1 ; 柴同杰 2 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

2.山东农业大学动物科技学院

关键词: 热应激蛋白HSP70;cDNA;剑尾鱼;克隆;序列

期刊名称: 大连水产学院学报

ISSN: 1000-9957

年卷期: 2007 年 22 卷 01 期

页码: 1-5

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了进一步开展剑尾鱼Xiphophorus helleri——标准化实验动物在抗逆方面的相关研究,以及热应激蛋白(HSP70)在抗逆方面的作用,作者用RT-PCR方法首次克隆得到了剑尾鱼的HSP70的cDNA片段,该片段包含HSP70的特征性序列(GAT CTC GGT GGT GGC ACT TTT GAT)。通过将克隆片段与已发表的其它鱼类HSP70的核苷酸序列和其编码的氨基酸序列进行同源性比较,发现剑尾鱼核苷酸序列同源性较高,与牙鲆Paralichthys olivaceus HSP70核苷酸序列同源性最高为89%,与川鲽Platichthys flesus、虹鳟Oncorhyn-chus mykiss和黄锡鲷Rhabdosargus sarba的同源性皆在85%以上;与国外学者发表的HSP70的规律类似,所克隆的片段与其它鱼类HSP70基因编码的氨基酸序列同源性较相应核苷酸序列同源性更高,与牙鲆和川鲽的HSP70氨基酸序列同源性最高达到99%,与斑马鱼Danio rerio、虹鳟和黄锡鲷的氨基酸序列同源性均高于97%。不同鱼的HSP70 cDNA核苷酸序列存在一定差异,但氨基酸序列并未受到影响,经对照,这种不同相当一部分存在于密码子的第3个碱基,因为密码子的简并性,编码氨基酸没有发生改变。

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