文献类型： 中文期刊
作者： 王世会 1 ; 贾智英 1 ; 李池陶 1 ; 孙志鹏 1 ; 石连玉 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
关键词： 锦鲤疱疹病毒;ORF72基因;结构功能分析
期刊名称： 水产学杂志
ISSN： 1005-3832
年卷期： 2016 年 29 卷 03 期
页码： 9-15
摘要： 于辽宁丹东采集感染锦鲤疱疹病毒的活鲤Cyprinus carpio样品,经DNA提取、PCR扩增、重组质粒构建步骤成功克隆锦鲤疱疹病毒ORF72基因,并利用生物信息学软件分析ORF72蛋白结构与功能,构建系统进化树。结果显示:ORF72基因开放阅读框共1113bp,编码蛋白由370个氨基酸组成,理论相对分子质量为40.5KD;ORF72蛋白主要由α螺旋、β折叠、无规则卷曲3种二级结构组成;N端35个氨基酸序列为信号肽序列。跨膜结构分析表明:ORF72蛋白无跨膜区,保守结构域预测表明ORF72含有一个保守结构域,抗原表位分析表明,抗原性较好。结构预测显示:ORF72氨基酸序列存在2个潜在的N-糖基化位点、1个潜在的O-糖基化位点、19个潜在的磷酸化位点。系统进化树分析发现,其与锦鲤疱疹病毒美国株、以色列株属同一分支。
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