文献类型： 中文期刊

作者： 赵庆 ¹ ; 吴彪 ¹ ; 刘志鸿 ¹ ; 刘寒苗 ¹ ; 孙秀俊 ¹ ; 周丽青 ¹ ; 张高伟 ¹ ; 杨爱国 ¹ ;

作者机构： 1.农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所;水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学;海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛海洋科学与技术国家实验室

关键词： DNA条形码;线粒体COI;贝类;系统进化

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 847-857

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： DNA条形码旨在通过PCR技术获得一段DNA序列,在物种水平上对现存生物类群和未知生物材料进行识别和鉴定。线粒体细胞色素C氧化酶I(COI)基因是常用DNA条形码基因之一,为研究COI基因作为DNA条形码在贝类系统进化中的评估效果,本文利用PCR技术扩增获得了60个贝类物种的353条COI基因序列,通过聚类法构建了neighbor-joining(NJ)进化树,同时还对7个物种不同地理群体的遗传进化情况进行了分析。结果表明,选用的COI基因引物在大多数贝类中通用性较强,除在珍珠贝目中的扩增效率只有10%以外,在整个研究中扩增效率达到82.7%;60个物种中除太平洋潜泥蛤(Panopea abrupta)、沼蛤(Limnoperna fortunei)和魁蚶(Scapharca broughtoni)等8个物种在进化树中的进化地位与传统系统分类具有一定差别外,其他物种的聚类关系与传统分类基本一致;对7个物种、共26个地理群体的聚类分析发现,COI基因基本能对同一物种的不同地理群体进行聚类,只有极个别群体或群体中的某个个体存在聚类混乱现象。综上所述,COI基因在一定程度上适用于贝类物种鉴别和系统发育研究,丰富了COI基因在物种鉴别应用中的科学数据。