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绒山羊FGF5基因启动子至第二外显子片段的序列拼接及启动子的预测和序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭慧琴 1 ; 苏少锋 2 ; 郭俊 2 ; 王潇 2 ; 尹俊 2 ;

作者机构： 1.内蒙古农业大学生命科学学院

2.内蒙古农业大学生命科学学院;内蒙古自治区农牧业科学院

关键词： 绒山羊;FGF5基因;序列拼接;启动子

期刊名称： 内蒙古农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1009-3575

年卷期： 2014 年 06 期

页码： 60-67

收录情况： 北大核心

摘要： 为构建绒山羊FGF5基因敲除载体及探明FGF5基因更多的序列信息,通过PCR方法分别扩增获得FGF5基因上游启动子至第一外显子1.6 kb片段、第一内含子至部分第二外显子8.0 kb片段及1.8 kb、2.4 kb和4.5 kb三段缺口片段。分别对以上PCR扩增片段进行测序,通过序列比对分析拼接获得了全长为9483 bp FGF5基因的部分序列,其结构包括编码区上游1 255 bp、第一外显子364 bp,第一内含子7 809 bp、部分第二外显子55 bp。并对绒山羊、绵羊、牛的FGF5基因启动子序列进行了分析,结果显示绒山羊和绵羊只有5个核苷酸的差异,而与牛的序列比较发现差异较大,牛的启动子中缺失了一个24 bp的DNA序列。本研究获得了绒山羊FGF5基因启动子至第二外显子部分序列的共9 483 bp的序列,为构建绒山羊FGF5基因敲除载体及探究FGF5基因的功能奠定了基础。

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