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基于InDel标记的杏鲍菇遗传多样性评价

文献类型: 中文期刊

作者: 姜晓红 1 ; 朱家漘 1 ; 孙忠刚 2 ; 曲绍轩 1 ; 马林 1 ; 李辉平 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

2.江苏淮香食用菌有限公司

关键词: 杏鲍菇;基因组比对;分子标记;种质资源评价

期刊名称: 食药用菌

ISSN:

年卷期: 2023 年 006 期

页码: 385-390

摘要: 插入/缺失(insertion-deletion,InDel)标记作为快速鉴定品种间遗传多样性的方法之一,因具有对检测设备要求低、简单易行、成本低,且共显性遗传、变异稳定、准确性高、重复性好等特点,在医学、动植物遗传学的群体遗传分析、基因定位及遗传图谱构建等领域被广泛应用。为评价我国杏鲍菇菌株的遗传多样性,加快杏鲍菇遗传育种工作进程,通过比对杏鲍菇已公布的基因组组装数据,开发30~200 bp InDel标记便于常规电泳检测,随机选取合成36对引物对收集自国家食用菌标准菌株库、国内企业和市场的65份杏鲍菇菌株进行验证,筛选出25对有效引物,进行遗传多样性分析并构建UPGMA聚类树。结果表明,65份供试菌株遗传多样性丰富,遗传相似系数最低为0.362,在相似系数0.616时可分为5个类群。

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