文献类型： 中文期刊

作者： 刘娅楠 ¹ ; 蒲金基 ¹ ; 张贺 ¹ ; 周芳雪 ¹ ; 杨永利 ¹ ; 张恺莉 ¹ ; 刘晓妹 ¹ ;

作者机构： 1.海南大学环境与植物保护学院海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室

关键词： 芒果;胶孢炭疽菌;小柱孢酮脱水酶基因SCD1;克隆;敲除载体

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 894-899

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 芒果炭疽病(Colletotrichum gloeosporioides)是为害芒果的重要病害之一,为了明确小柱孢酮脱水酶基因SCD1与芒果炭疽病菌致病力之间的相互关系,本研究以芒果炭疽病菌DNA为模板,利用同源克隆技术扩增SCD1,分析其序列特征、推测了其蛋白的保守结构域,并借助In-Fusion~ HD Cloning Kit技术进行敲除载体构建。结果表明,该基因DNA和cDNA全长分别为796 bp、564 bp,编码区有两个内含子(大小为52 bp,180 bp),推测编码187个氨基酸,其分子量约为21.52 kD,等电点PI为5.90,与NCBI网站中已公布的基因进行Blastp比对,发现该序列与香蕉炭疽菌(C.musae)、无花果炭疽菌(C.caricae)(登录号:GQ266389.1,GQ266386.1)的小柱孢酮脱水酶基因相似性分别为98%和97%。该基因的敲除载体pSCDGH-1已构建成功,为下一步获得SCD1基因敲除突变体,研究该基因功能打下了材料基础。