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一个木薯候选STK类抗病基因的分离及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈奕鹏 1 ; 李超萍 1 ; 樊春俊 1 ; 时涛 1 ; 李博勋 1 ; 黄贵修 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室/海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室

关键词： 木薯;候选抗病基因;丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶

期刊名称： 热带农业科学

ISSN： 1009-2196

年卷期： 2016 年 36 卷 12 期

页码： 27-32

摘要： 根据丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类(STK)结构域Ⅰ和Ⅷ氨基酸保守序列设计了1对简并引物,以细菌性萎蔫病抗/感木薯种质E1340和GR911基因组DNA为模板,通过PCR扩增,均获得大小约0.5 kb的扩增片段。两个片段纯化、克隆、测序后获得完全一致的505 nt序列,比对发现,木薯种质AM560带有和该序列高度同源的核苷酸片段。对包括同源片段上下游各约2.0 kb的大片段序列进行基因预测,获得1个有4个外显子、ORF全长1866 nt的预测基因,命名SSK1。序列分析表明,该基因编码621 aa,有细胞壁受体激酶结合、偶联位点和8个跨膜结构域,具有典型的STK类抗病基因的保守结构,是一个候选的抗病基因,可能在木薯抗病反应中发挥重要作用。

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