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基于重测序数据的猪繁殖性状全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吕玲燕 1 ; 林昌华 2 ; 张胜斌 3 ; 覃秀珍 3 ; 柏秀芳 3 ; 吴永绍 1 ; 陈钊 1 ; 刘磊 1 ; 孙如玉 1 ; 张冰 1 ; 张家庆 4 ;

作者机构: 1.广西农业职业技术大学畜牧研究院

2.广西大学动物科学技术学院

3.广西农垦永新畜牧集团西江有限公司

4.河南省农业科学院畜牧研究所

关键词: 重测序;猪;繁殖性状;全基因组关联分析

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2025 年 61 卷 001 期

页码: 235-241

收录情况: 北大核心

摘要: 为从全基因组水平上探究影响母猪繁殖性状的分子机理,本试验对连续3胎不同产仔数的母猪进行全基因组重测序及关联分析,挖掘参与调控母猪高低产仔数性状的关键调控基因。本试验选取高繁母猪21头,低繁母猪19头,采用illumina novaseq 6000 PE150平台对40个文库进行全基因组重测序,结合母猪连续3胎产仔数的表型性状,基于GLM混合线性模型,并利用质控后的14 708 672个SNP标记进行全基因组关联分析。结果表明:总产仔数性状有87个SNP达基因组水平显著,候选基因包括RORA、SFRP1、HSD17B1、IGF1;产活仔数性状有73个SNP达基因组水平显著,候选基因包括DAZL、STAT3;健仔数性状有66个SNP呈基因组水平显著,候选基因包括DAZL、HSD17B1、STAT3;根据基因功能注释推测IGF1、DAZL、HSD17B1、SFRP1、STAT3是繁殖性状的重要候选基因。本研究为猪繁殖性状的基因组选择提供了重要的理论基础。

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