文献类型： 中文期刊
作者： 黄立飞 1 ; 房伯平 1 ; 陈景益 1 ; 张雄坚 1 ; 罗忠霞 1 ;
作者机构： 1.广东省农业科学院作物研究所
关键词： 甘薯;EST-SSR;基元
期刊名称： 植物生理学通讯
ISSN： 0412-0922
年卷期： 2009 年 01 期
页码： 23-27
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 从NCBI公共数据库下载获得22371条甘薯EST序列,去除低质量的和冗余的序列后,得到总长为5.09×103kb的9204条唯一序列。从这些序列中搜索到总共436个SSR位点,平均相距11.68kb出现一个SSR。这些SSR的出现频率和平均长度分别为4.4%和24.28bp。在2～6bp的重复基元中,六核苷酸重复基元出现频率最高(30.96%),其次是三核苷酸重复基元(29.59%)和二核苷酸重复基元(24.54%)。出现最多的重复基元是AG/CT(16.28%),其次是AAG/CTT(11.01%)。
- 相关文献
[1]基于EST-SSR标记的甘薯种质资源DNA指纹图谱构建. 罗忠霞,房伯平,李茹,王章英,黄立飞,陈景益,张雄坚,李育军,陈新亮,黄实辉. 2014
[2]De Novo Characterization of Leaf Transcriptome Using 454 Sequencing and Development of EST-SSR Markers in Tea (Camellia sinensis). Wu, Hualing,Chen, Dong,Li, Jiaxian,Qiao, Xiaoyan,Huang, Hualin,He, Yumei,Wu, Hualing,Chen, Dong,Li, Jiaxian,Qiao, Xiaoyan,Huang, Hualin,He, Yumei,Yu, Bo.
[3]Core EST-SSR Marker Selection Based on Genetic Linkage Map Construction and Their Application in Genetic Diversity Analysis of Litchi (Litchi chinensis Sonn.) Germplasm Resources. Xiang, X.,Chen, D. M.,Ma, S. P.,Ma, W. C.,Fan, J.,Yang, X. Y.,Liu, M.,Sun, Q. M.. 2014
[4]丝瓜(Luffa cylindrica)EST-SSR分子标记的验证及多态性分析. 骆彩霞,罗剑宁,赵钢军,何晓莉,周玲艳,吴海滨. 2020
[5]肇实转录组测序及生物信息学分析 被引量:1. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019
[6]肇实转录组测序及生物信息学分析. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019
[7]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020
[8]利用SNP和EST-SSR分子标记鉴定荔枝新种质御金球. 孙清明,李永忠,向旭,陈道明,杨晓燕,方静,吴绪波,周东辉,马帅鹏,马文朝. 2013
[9]利用EST-SSR分子标记鉴别荔枝新品种红灯笼. 向旭,欧良喜,白丽军,赵俊生,孙清明,陈洁珍,蔡长河. 2010
[10]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011
[11]广东仁化白毛茶优异株系遗传多样性的EST-SSR分析. 乔小燕,吴华玲,陈栋,李家贤,黄华林,晏嫦妤,何玉媚. 2010
[12]EST-SSR标记在蔬菜作物中的开发和应用进展. 吴海滨,罗少波,罗剑宁,龚浩,何晓莉. 2012
[13]中国96个荔枝种质资源的EST-SSR遗传多样性分析. 向旭,欧良喜,陈厚彬,孙清明,陈洁珍,蔡长河,白丽军,赵俊生. 2010
[14]荔枝两个F_1杂交群体的EST-SSR鉴定及多样性分析. 孙清明,马帅鹏,马文朝,赵俊生,方静,杨晓燕,向旭. 2014
[15]甘薯EST-SSR引物开发及有效性检测. 罗忠霞,房伯平,王章英,李俊,陈新亮,黄立飞,陈景益,张雄坚,李育军. 2011
[16]甘薯新病害茎腐病的识别与防治. 黄立飞,罗忠霞,邓铭光,房伯平,陈景益,张雄坚,王章英,黄实辉. 2011
[17]DNA分子标记技术在甘薯种质资源和遗传育种中的应用现状. 安康,房伯平,陈景益,张雄坚,符史立. 2005
[18]广东省"十五"以来甘薯育种研究进展. 房伯平,陈景益,张雄坚,安康. 2005
[19]应用AMMI模型分析甘薯品种(系)的稳定性与区试点的判别力. 陈景益,房伯平,罗森辉,张雄坚,胡学应,安康,司徒志谋. 2005
[20]甘薯种质资源收集、保存、鉴定与利用. 房伯平,张雄坚,陈景益,安康. 2005
作者其他论文 更多>>
-
扶桑绵粉蚧的识别及防治
作者：徐藤双;周洁玲;罗克波;黄立飞
关键词：甘薯;扶桑绵粉蚧;特征特性;防治
-
甘薯疮痂病菌的生物学特性和产孢方法研究
作者：张新新;黄雍;陈景益;邹宏达;罗忠霞;王章英;黄立飞
关键词：甘薯疮痂病;Elsinoe;BATATAS;生物学特性;产孢;菌丝涂布法
-
基于表型性状和SSR分子标记构建甘薯核心种质
作者：陈伊航;唐朝臣;张雄坚;姚祝芳;江炳志;王章英
关键词：甘薯;核心种质;表型性状;SSR分子标记;种质资源
-
2株甘薯强致病力镰刀菌的室内药剂筛选
作者：陈新亮;陈景益;罗忠霞;王章英;房伯平;王小斌;黄立飞
关键词：甘薯;爪哇镰刀菌;尖孢镰刀菌;毒力测定
-
山药新品种白莳药16的选育
作者：刘也楠;何贤彪;林飞荣;黄立飞;刘伟明
关键词：山药;白莳药16;系统选育
-
单细胞转录组测序技术发展及其在甘薯中的应用
作者：赵楠;梁雪莲;谢淑燕;张新新;马婷婷;邹宏达;陈景益;房伯平;黄立飞
关键词：单细胞转录组测序;甘薯育种;细胞异质性
-
甘薯病虫害的研究特征与趋势述评
作者：王世鑫;唐朝臣;罗梅;陈景益;邹宏达;董章勇;黄立飞
关键词：甘薯;病虫害;文献计量学;可视化分析;CiteSpace
