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Na~+-K~+-ATPase α1基因全长cDNA的克隆及序列分析和表达

文献类型: 中文期刊

作者: 刘珊 1 ; 李冰 2 ; 张成锋 2 ; 魏可鹏 2 ; 朱健 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.南京农业大学无锡渔业学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

关键词: 建鲤;Na+-K+-ATPase α1;克隆;序列分析;组织表达

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2012 年 19 卷 04 期

页码: 594-603

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解Na+-K+-ATPase α1基因的分子结构及其在建鲤盐度调控过程中起到的作用,采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)的方法分离克隆了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)Na+-K+-ATPase α1基因全长cDNA,得到3 397 bp的全长cDNA,包括3 081 bp的开放阅读框(ORF),232 bp的5-末端非编码区(UTR)以及219 bp的3-末端非编码区(UTR)。对推测的该基因氨基酸序列进行同源性比对和系统分析显示:建鲤与其他鱼类该基因的氨基酸序列相似度为90.22%~95.52%,与斑马鱼(Danio rerio)相似度最高(95.52%),与虱目鱼(Chanos chanos)相似度偏低,其次是平鲷(Rhabdosargus sarba)、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)、底鳉(Fundulus heteroclitus)、黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)、马苏大马哈鱼(Oncorhynchus masou)和虹鳟(Oncorhynchus mykiss),与大西洋鲑(Salmo salar)的相似度最低(90.22%),与非洲爪蟾(Xenopus laevis)和人(Homo sapiens)的相似度分别为89.62%和89.51%。以上结果表明,不同物种间的Na+-K+-ATPaseα1基因的氨基酸序列极为保守。用实时定量PCR(RT-PCR)检测该基因在建鲤鳃、肾、肠、肝、脑和脾的相对表达量,其中脑最高,其次是鳃、脾、肾、肠,肝最低,这表明脑、鳃和脾是建鲤Na+-K+-ATPase α1基因主要的表达器官。本研究旨为进一步探索建鲤的盐度调控机制奠定分子基础。

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