您好，欢迎访问贵州省农业科学院 机构知识库！
贵州省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

侵染贵州火龙果的仙人指X病毒的基因组序列变异

文献类型： 中文期刊

作者： 郑乾明 1 ; 王小柯 1 ; 马玉华 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院果树科学研究所

关键词： 高通量测序;系统进化;外壳蛋白;分子变异;火龙果

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 95-98

摘要： 为仙人指X病毒(Schlumbergera virus X,SchVX)的分子检测与防控提供理论基础,利用基于Illumina平台的高通量测序分析6份疑似病毒感染贵州火龙果样品,研究侵染火龙果的仙人指X病毒发生情况和遗传变异。结果表明:在5份样品中获得大量SchVX相关序列,占样品序列数的3. 7%～17. 5%;SchVX贵州分离物与参考基因组(Genbank登录号:KP090203)的序列一致性为82. 8%～100. 0%; SchVX贵州分离物之间编码外壳蛋白的核苷酸序列和推导的氨基酸序列一致性分别为92. 5%～97. 3%和96. 0%～99. 1%,分别与来自于仙人掌科其他寄主的NI、K11和Palma-PE分离物序列一致性类似,略高于nopal verdure 1分离物; SchVX贵州分离物与NI、K11和Palma-PE分离物亲缘关系较近,与nopal verdure 1分离物较远。样品采集地的火龙果普遍受SchVX侵染,其基因组序列存在一定程度的分子变异。

  • 相关文献

[1]1个侵染贵州火龙果的仙人指X病毒新的分离物基因组序列分析. 郑乾明,王小柯,马玉华. 2025

[2]贵州烟草马铃薯Y病毒株系分析. 王莉爽,陈文,谭清群,吴石平,袁洁. 2015

[3]马铃薯X病毒外壳蛋白基因的克隆与系统进化分析. 黄永会,朱英,刘永翔. 2014

[4]贵州烟草花叶病毒株系初探. 王莉爽,吴石平,杨学辉,何海永,陈小均,袁洁. 2012

[5]抗马铃薯Y病毒的ihpRNA高效茎长度的选择. 刘新建,陶刚,刘永翔,朱英,邱礽,李奇科,刘作易. 2011

[6]侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析. 郑乾明,王小柯,王壮,马玉华. 2019

[7]马铃薯X病毒外壳蛋白基因片段的瞬时表达诱导对PVX的高抗性(英文). 黄永会,陶刚,朱英,Mariena Ketudat-Cairns,邱礽,刘永翔,刘作易. 2011

[8]中国矮马群体mtDNA Cytb基因遗传多样性及系统进化研究. 徐龙鑫,杨胜林,李爱萍,乜玉丽,杨海兵,戴焰. 2013

[9]线粒体DNA的研究与应用. 熊庆,刘作易,喻子牛. 2002

[10]珍稀绢丝昆虫柳蚕的DNA条形编码与系统进化初步分析. 濮佳明,武松,霍锡敏,王欢,夏润玺,李喜升,王振东,罗朝斌,刘彦群. 2009

[11]百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析. 丘日光,张天缘,杨仕梅,宋莉,赵德刚. 2019

[12]贵州芸薹黄化病毒的分子检测及基因型鉴定. 王莉爽,李淳,陈小均,何海永,陈文,黄露,刘学辉. 2021

[13]木薯NHX基因家族鉴定及特征分析. 杨仕梅,谢恩俊,罗春芳,饶萍,欧珍贵,杨龙. 2024

[14]三个多倍体猕猴桃基因组Survey分析及系统进化研究. 周嘉,王飞飞,仲伟敏,齐勇,刘青,史斌斌,张晟,牛歆雨,郑乾明,唐冬梅. 2024

[15]火龙果营养研究及开发现状. 谢国芳,周俊良,韩秀梅,张银,杨月. 2013

[16]喀斯特山区火龙果栽培技术要点. 颜艳. 2014

[17]火龙果抗寒性检测初探. 邓仁菊,范建新,王彬,蔡永强. 2009

[18]2015年关岭县火龙果钾肥总控量试验初报. 甘南孝,朱安乐,左栋清,马艳,文凭,李裕荣. 2016

[19]罗甸县种植火龙果的气候适应性分析. 刘朝英,谭清波,石廷娅,韦茜. 2012

[20]火龙果嫁接栽培技术的多媒体课件制作. 文竹,冉争光. 2013

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：贵州省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台