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芒果NBS类抗病基因同源序列克隆与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘洋 1 ; 姚全胜 2 ; 苏俊波 2 ; 洪亚楠 1 ; 雷新涛 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院湛江实验站

2.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 芒果;NBS;抗病类基因;同源克隆;聚类分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2013 年 14 卷 03 期

页码： 571-576

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据已知物种NBS抗病类基因(RGAs)保守序列设计引物,从芒果品种金煌基因组DNA中分离得到了10条同源序列(pp-1～10,GenBank登录号为HM446507～16)。DNA序列分析表明,这些RGAs在200～300 bp区间存在较大变异,Pi值都在0.4以上。同源性分析表明这些序列的同源性差异范围从11.0%～98.4%,离散值范围为1.6～100.7,10条RGAs可以分为2大类。蛋白序列分析表明,pp-01～10都具有开放读码框,编码的蛋白含有典型的NBS抗病类基因所拥有的P-loop和Kinase-2a结构域,通过同源进化分析可将其分为TIR-NBS-LRR和CC-NBS-LRR 2类,与已知物种同源性范围为20%～60.2%。

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