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基于简化基因组技术的33份芒果品种遗传分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王露露 1 ; 王磊 1 ; 姚全胜 1 ; 周开兵 1 ; 柳凤 1 ;

作者机构： 1.海南大学园艺学院;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室,农业农村部热带果树生物学重点实验室

关键词： 芒果;简化基因组测序;遗传分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 011 期

页码： 3627-3637

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 芒果具有丰富的种质资源,目前关于芒果育种材料与抗病性遗传结构和亲缘关系相关性的研究较少.为分析探究不同抗、感细菌性角斑病芒果品种的遗传结构和亲缘关系,本研究采用GBS(Genotypingby sequencing)简化基因组测序技术对33份芒果材料进行测序,基于数据处理后的SNP信息进行系统进化树分析、主成分分析和群体遗传结构分析,分析芒果种质材料的遗传进化和亲缘关系,结合前期抗病性评价实验结果探究其遗传分化特点及与抗病性的相关性.结果表明,33份芒果品种可划分为7个类群,类群Ⅰ包含7个高、中抗品种中的5个;类群Ⅲ与类群Ⅳ遗传距离近,包含了 4个高感品种中的3个;群体结构分析最佳分群数为9;主成分分析显示这些芒果品种整体没有产生特别明显的分组,但是各品种间的遗传距离远近关系和进化树结果基本一致;遗传多样性分析中,所有芒果品种的期望杂合度为0.336 1,多态性信息含量(PIC)为0.269 4,有效等位基因数1.573 2个,Shannon信息指数为0.504 1,表明芒果遗传多样性较低;且从高抗品种到感病品种的各项遗传多样性指标由高到低分别为中感>感病>中抗>高感>高抗,说明这些品种中高感品种、高抗品种相对其他抗感病梯度的品种,各自之间的遗传一致性较高,而中感品种的遗传多样性高.以上结果表明芒果高感品种与高抗品种之间遗传差异大,亲缘关系远;群体血统混合在一定程度上可能有助于提高品种抗病性.该研究结果为今后芒果杂交育种、种质创制、芒果种质资源开发利用等提供理论依据.

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