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基于细胞色素B(Cyt b)基因对翘嘴鲌不同群体遗传多样性的分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张桂宁 1 ; 方弟安 1 ; 薛向平 1 ; 张敏莹 2 ; 冯晓婷 1 ; 杨雪军 1 ;

作者机构: 1.上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站

关键词: 翘嘴鲌;线粒体DNA;细胞色素b基因;遗传多样性

期刊名称: 中国农学通报

ISSN:

年卷期: 2021 年 023 期

页码: 118-124

收录情况: CSCD

摘要: 为了解长江下游翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)不同群体遗传多样性水平,评估其资源状况。研究以淀山湖(DSH)、太湖(TH)、长荡湖(CD)和长江(CJ)4个水域共211尾翘嘴鲌为研究对象,对其线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)序列进行测序分析,所得基因序列在NCBI中比对,运用MEGA、DNASP等软件分析得到4个翘嘴鲌群体的遗传多样性数据。翘嘴鲌Cyt b基因序列长度为1088 bp,其中碱基A+T含量为55%,G+C为45%。共检测到258个多态位点,占核苷酸总数的23.71%。4个群体211个样本中得到46个单倍型,单倍型多样性为0.8490.946,具体表现为TH>CD>CJ>DSH。核苷酸多样性为0.00830.174,具体表现为DSH> CD>CJ>DSH。4个群体间遗传距离0.0520.152,太湖群体和淀山湖群体的群体间遗传距离最大为0.152。群体间的遗传分化指数范围为0.1970.646,基因流值范围为0.1521.019,其中长江与淀山湖群体的基因流值最小,长江与长荡湖群体的基因流值最大。基于NJ法构建的系统进化树结果显示,4个群体翘嘴鲌没有明显地理区分。本研究结果表明,长江下游翘嘴鲌群体遗传多样性较高,结合近年来翘嘴鲌渔业资源的调查结果,以深入了解其遗传背景和种质资源现状,为翘嘴鲌的野生资源保护提供基础数据。

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