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南方拟微卫星标记筛选及遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 苏钰玲 1 ; 李敏 1 ; 杨永春 1 ; 刘佳豪 1 ; 李振海 1 ; 阮惠婷 1 ; 戴嘉格 1 ; 刘丽 1 ; 邹柯姝 1 ;

作者机构: 1.华南农业大学海洋学院;中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部外海渔业开发重点实验室

关键词: 南方拟■;珠江流域;微卫星;遗传多样性

期刊名称: 水产科学

ISSN: 1003-1111

年卷期: 2020 年 02 期

页码: 224-233

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 南方拟■是一种分布于长江以南各水系的小型经济鱼类,目前仅有野生资源。为查明珠江流域其群体遗传结构现状,试验采用RAD-Seq技术筛选出36个多态性微卫星标记,其中29个为高度多态性(多态信息含量>0.50)位点,6个为中度多态性(0.25<多态信息含量<0.50)位点和1个为低度多态性(多态信息含量<0.25)位点。选取6个高度多态性位点研究珠江流域的北江、桂江、都柳江、融江、左江、右江、黔江及郁江8个江段南方拟■群体的遗传多样性和种群分化情况,结果显示,共检测到98.17个等位基因,平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、香农指数和多态信息含量值分别12.2713、6.0575、0.5389、0.7679、1.8974和0.7379,表明珠江流域南方拟■的遗传多样性丰富。6个微卫星位点在8个群体中检测结果显示,平均群体间分化系数为0.1028,表明10.28%的遗传变异来自于群体间,89.72%的遗传变异来自于群体内,属于中等分化水平;平均群体内近交系数为0.2987,表明群体内杂合子缺失严重;基因流为1.0075~4.7308,说明群体间的基因流足以抵制遗传漂变。本研究的结果可为南方拟■种质资源保护和开发利用提供科学依据。

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