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军曹鱼MHC-Ⅰα基因全长cDNA的克隆及其组织表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张鹤 1 ; 茅莉娜 2 ; 冯娟 2 ; 管越强 1 ; 许海东 2 ; 苏友禄 2 ;

作者机构： 1.河北大学生命科学学院

2.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 军曹鱼;MHC-Ⅰα;全长cDNA;组织特异性表达

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2011 年 7 卷 01 期

页码： 10-19

摘要： 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)方法,得到1 330 bp的军曹鱼(Rachycentron canadum)MHC-Ⅰα全长cDNA片段。该序列包括76 bp的5′末端非编码区(UTR),189 bp的3′UTR及1 065 bp的开放阅读框(ORF),编码354个氨基酸,预测其蛋白质分子量约40.10 kDa,等电点5.70。构建MHC-Ⅰα氨基酸序列的系统进化树并进行氨基酸相似性比对,结果表明,军曹鱼和已知鱼类及人类(Homo sapiens)MHC-Ⅰα氨基酸的同源性在27.9%~67.1%之间。所推测的蛋白序列具有一些重要特征,包括前导肽、α1、α2、α3区、CP/TM/CYT区和保守的半胱氨酸等。Real-time PCR检测结果显示,MHC-Ⅰα基因在各个正常军曹鱼组织中均表达,但表达量各有不同,其中较强的表达于头肾;中等程度表达于鳃、脾和肠;在心、脑和肌肉中表达较弱。

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