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双锯鱼(Amphiprion)胚胎不同发育阶段和成鱼不同组织中内参基因的筛选及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 李迎娣 1 ; 孙志宾 1 ; 马爱军 1 ; 杨敬昆 1 ; 刘志峰 1 ; 于宏 1 ; 赵亭亭 1 ; 常浩文 1 ; 朱理光 1 ; 刘诗颖 1 ; 曲江波 1 ;

作者机构: 1.上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室;青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室;中国-东盟海水养殖技术“一带一路”联合实验室;烟台开发区天源水产有限公司

关键词: 双锯鱼;内参基因;TYR基因;qPCR;geNorm;Norm Finder

期刊名称: 海洋与湖沼

ISSN: 0029-814X

年卷期: 2022 年 01 期

页码: 150-160

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 双锯鱼(Amphiprion)亦称为海葵鱼,又称为小丑鱼,是一类经济价值较高的海水观赏鱼。目前国内在双锯鱼的胚胎发育、人工饲养以及形态学观察等方面已经取得了有效成果,但在分子生物学水平上对其基因表达的研究较少。为了筛选出适用于双锯鱼胚胎不同发育阶段以及成鱼组织的内参基因,分析酪氨酸酶(TYR)基因的表达情况,以眼斑双锯鱼(A.ocellaris)和白条双锯鱼(A.frenatus)为材料,利用实时定量聚合酶链式反应(qPCR)对18SrRNA、GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因)、Ef-1α(转录延伸因子基因)和β-actin(β-肌动蛋白基因)这4个候选内参基因的表达水平进行检测,同时通过geNorm和Norm Finder软件对其稳定性进行评估,最后以合适的内参基因作为参考,研究TYR mRNA的表达水平。结果表明,在双锯鱼胚胎的不同发育阶段,18S和β-actin的表达量相对于其他基因较为稳定;在双锯鱼的不同组织中,稳定性依次为18S>β-actin>Ef-1α>GAPDH。以18S作为内参基因时分析发现TYR基因的表达在双锯鱼胚胎发育过程中呈先上升后下降的趋势,在体节期表达量最高;在双锯鱼各组织中均有表达,且在眼、尾和红皮中表达量最高。

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