您好,欢迎访问贵州省农业科学院 机构知识库!

基于高深度重测序的春性、半冬性和冬性甘蓝型油菜基因组遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡鸣 1 ; 姚圣黎 2 ; 程晓晖 2 ; 刘越英 2 ; 马立新 2 ; 向阳 2 ; 黄军艳 2 ; 童超波 2 ; 刘胜毅 3 ;

作者机构: 1.中国农业科学院油料作物研究所农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室;湖北大学/生物资源绿色转化湖北省协同创新中心;贵州省农业科学院油料作物研究所

2.;中国农业科学院油料作物研究所农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室;湖北大学/生物资源绿色转化湖北省协同创新中心;贵州省农业科学院油料作物研究所

3.;中国农业科学院油料作物研究所农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室;湖北大学/生物资源绿色转化湖北省协同创新中心;贵州省农业科学院油料作物研究所;

关键词: 甘蓝型油菜;生态适应型;遗传变异;高通量测序

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2018 年 40 卷 04 期

页码: 469-478

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究不同生态适应型甘蓝型油菜之间的遗传变异,采用高通量测序手段对春性、冬性和半冬性甘蓝型油菜代表性品种(奥罗、Darmor-Bzh和中双11号)进行了高深度重测序。通过遗传变异比较分析,在春性和冬性、春性和半冬性、半冬性和冬性之间检测到丰富的遗传变异,包括SNP、Indel、结构变异和拷贝数变异等。在春性和冬性、半冬性和冬性、春性和半冬性甘蓝型油菜之间存在遗传变异分布的基因数目分别为43 983、44 592和44 991个。对这些基因进行GO富集分析,发现它们主要富集在基础代谢、生长发育调控和环境适应性等相关的GO类别中。针对不同生态型之间的差异特点,重点关注开花时间的调控网络,发现与植物春化途径、赤霉素途径、衰老途径等相关的重要基因FLC、VRN、GA、SPL3等同源拷贝中均存在遗传变异,推测这些基因功能可能与甘蓝型油菜不同生态适应型的形成相关。本研究在不同生态适应型品种内检测到的大量的遗传变异以及这些变异在基因中的分布为解释甘蓝型油菜不同生态适应型的形成提供了遗传基础,为后续的分子育种以及改良生态适应型提供理论指导。

  • 相关文献

[1]利用AFLP标记对鄂西多花木蓝材料遗传变异的分析. 罗天琼,张建波,莫本田,张瑜,龙忠富,王普昶. 2016

[2]百宜黑鸡与兴义矮脚鸡、长顺绿壳蛋鸡的遗传变异研究. 阳光远,王文涛,张小林,傅筑荫,陈彬. 2011

[3]瑶山鸡TRHR基因编码区序列SNP检测及其与繁殖性状的相关性. 伍革民,徐龙鑫,朱丽莉,唐继高. 2017

[4]荔波瑶山鸡NSG1基因变异检测及与繁殖性状关联分析. 伍革民,徐龙鑫,朱丽莉,唐继高. 2017

[5]百宜黑鸡mtDNA D-loop区遗传变异分析. 阳光远,张小林,王文涛,傅筑荫,陈彬. 2011

[6]贵州不同宿主布氏杆菌分离与遗传关系. 史开志,毛君婷,姜玲玲,徐洪忠,尚以顺,吴卫珩. 2014

[7]长顺绿壳蛋鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析. 韩雪,朱丽莉,粟朝芝,陶宇航. 2015

[8]贵州野生匍匐剪股颖POD等位酶位点遗传变异分析. 钟理,杨春燕,尚以顺,王小利,刘正书,陈伟. 2008

[9]百宜黑鸡与长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列分析. 王文涛,阳光远,陈彬. 2011

[10]侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析. 郑乾明,柏自琴,王小柯,林乾,王彬,马玉华. 2022

[11]贵州南部柑桔黄龙病菌两个原噬菌体位点遗传多样性分析. 柏自琴,王小柯,冯建文,李金强,罗会,罗怿,李兴忠,李文云,马玉华. 2019

[12]六盘水小黄姜脱毒快繁技术及遗传变异研究. 杨松宸,赵德刚,赵懿琛. 2017

[13]瑶山鸡TRH基因编码区序列变异及其与繁殖性状的相关性. 伍革民,朱丽莉,韩雪,唐继高. 2020

[14]TRH基因编码区序列变异及其与繁殖性状的相关性. 伍革民,朱丽莉,韩雪,唐继高. 2020

[15]热带玉米耐低氮性状的遗传变异(英文). 陈泽辉,A.L.Carpena. 2000

[16]荔波瑶山鸡血管活性肠肽及其受体基因变异与繁殖性状的关联性. 伍革民,朱丽莉,韩雪,唐继高. 2021

[17]清水江鲤基于微卫星标记和形态指标的遗传分析. 董在杰,刘念,朱文彬,傅建军,王兰梅,李建光,杨兴. 2018

[18]贵州柑桔主产区柑桔黄龙病菌发生及遗传多样性研究. 柏自琴,王雪峰,罗怿,罗会,陈守一,李金强. 2017

[19]贵州大豆地方品种农艺性状的遗传变异研究. 张太平. 1989

[20]贵州玉米地方种质主要性状遗传变异研究. 柏光晓,任洪,兰仲模,王明春,沈建华. 2007

作者其他论文 更多>>