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基于全基因组关联分析挖掘甘蓝型油菜油酸含量QTL与SNP分子标记

文献类型: 中文期刊

作者: 李敏 1 ; 方正 2 ; 陈俊锟 2 ; 梁龙兵 2 ; 向阳 2 ;

作者机构: 1.贵阳市白云区农业农村局

2.贵州省农业科学院/贵州省油菜研究所

关键词: 甘蓝型油菜;油酸含量;QTL;SNP分子标记

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2024 年 007 期

页码: 53-58

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究以国内外收集的300份甘蓝型油菜种质为材料,在2个环境下种植,结合油酸含量的表型和基因型数据,利用EMMAX软件进行全基因组关联分析。结果表明,关联群体的油酸含量分布呈连续性双峰分布,受2个主效基因位点控制;GWAS分析检测到一个控制油酸含量性状的主效QTL位点,位于C03染色体的第53853975~57808820位碱基之间,贡献率为62.51%,与chrC03_53853975(A/G)、chrC03_57808820(C/T) SNP分子标记及峰值SNP分子标记chrC03_56392730(G/T)紧密连锁,对应碱基突变导致多态性。峰值SNP等位基因为TT时,该性状表型效应值为57.93%。本研究首次揭示一种甘蓝型油菜籽油酸含量性状的C03染色体主效QTL位点及其SNP分子标记,贡献率高,为该性状的高效改良与分子标记辅助选择提供了重要理论依据。

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