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大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李胜杰 1 ; 樊佳佳 1 ; 姜鹏 1 ; 白俊杰 1 ; 孙建国 1 ; 吴建开 1 ; 费志平 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;南京帅丰饲料有限公司;湖州湖旺水产种业有限公司

关键词: 大口黑鲈;HSC70-1;关联分析;单核苷酸多态性;生长性状

期刊名称: 南方水产科学

ISSN: 2095-0780

年卷期: 2018 年 06 期

页码: 74-80

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探讨HSC70-1基因对大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状的影响作用,开发与生长性状相关的分子标记,该研究采用PCR技术扩增得到HSC70-1基因的cDNA和DNA全序列,编码区cDNA序列长1 953 bp,编码650个氨基酸,其DNA全序列长3 390 bp,包含8个外显子和7个内含子。采用直接测序法在该基因上筛选到4个单核苷酸多态性(SNP)位点,分别位于核苷酸序列中的第821、第1 105、第1 200和第2 804碱基处,且处于内含子上。SNP标记与性状的关联分析结果表明,C-821G位点上CC基因型个体的体质量和全长均显著高于CG和GG基因型(P<0.05)。A-2804T位点上TT基因型个体的体质量和全长均显著高于AT和AA基因型(P<0.05)。其他位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异(P>0.05)。通过合并基因型发现,双倍型D1 (CC--CCTT)的各个生长性状表现最优,在体高和全长上显著高于D5。C-821G、A-2804T和D1与生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记。

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