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山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 王德凤 1 ; 杨永强 2 ; 韩勇 1 ;

作者机构： 1.贵州省畜牧兽医研究所

2.贵州大学动物科学学院

关键词： 腺苷单磷酸脱氨酶1;单核苷酸多态性;启动子;小香羊;黔北麻羊;努比山羊

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2013 年 40 卷 07 期

页码： 127-132

收录情况： 北大核心

摘要： 为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。

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