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龙眼胚性愈伤组织DlHOS1基因克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 肖小娥 1 ; 徐小萍 2 ; 李佳蜜 2 ; 张梓浩 2 ; 赖瑞联 2 ; 林玉玲 2 ; 赖钟雄 3 ;

作者机构: 1.福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建省农业科学院果树研究所

2.;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建省农业科学院果树研究所

3.;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建省农业科学院果树研究所;

关键词: 龙眼;DlHOS1;基因克隆;密码子使用偏爱性;qPCR

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2018 年 02 期

页码: 293-299

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以龙眼胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE-PCR技术对植物抗寒重要调控因子HOS1(DlHOS1)进行克隆,并进行密码子使用偏爱性、生物信息学和低温胁迫下表达等方面的分析。结果表明:DlHOS1基因序列全长3 577 bp,包含ORF 3 000 bp,编码999个氨基酸,5’UTR和3’UTR分别162 bp和415 bp(GenBank登录号:KY990404);密码子使用偏爱性分析表明,DlHOS1密码子的选择偏爱性较弱,偏爱以A/T结尾;生物信息学分析结果表明,DlHOS1编码的蛋白属于不稳定的疏水性跨膜蛋白,不含信号肽,定位于细胞质和细胞核,二级结构富含α螺旋,与柑橘的亲缘关系较近;qPCR结果发现,DlHOS1能够响应低温胁迫诱导,总体上低温下其表达水平上升。研究结果认为,DlHOS1参与龙眼抗寒和低温胁迫过程。

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