文献类型： 中文期刊

作者： 于新艳 ¹ ; 王凤格 ² ; 赵久然 ² ; 王玺 ¹ ; 易红梅 ² ; 王璐 ² ; 郭景伦 ² ; 匡猛 ² ; 孙艳美 ² ;

作者机构： 1.沈阳农业大学农学院

2.北京市农林科学院玉米研究中心

关键词： 玉米;SSR;核心引物;引物设计

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2007 年 5 卷 03 期

页码： 151-155

收录情况： CSCD

摘要： 为了确定出适用于玉米DNA指纹库构建的引物,对部分并不是完全符合玉米DNA指纹库构建引物筛选原则的引物进行重新设计与优化,使其基本符合核心引物设计的要求。以umc2105、umc1705和phi299852为例,下载原引物的基因组序列,利用两个常用的引物设计软件Primer Premier5.0和Oligo6.57进行引物的重新设计及评估,在Tm值、GC含量、引发效率、错误引发率、3'端G值、引物二聚体等方面对引物进行改善,结果表明,经过对原引物的重新设计和优化,新设计的引物均能清晰的扩增,扩增效果得到了明显的改善,并且均能在统一的条件下进行实验,符合了玉米DNA指纹库构建的要求。