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长江中上游4个鲢群体遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈会娟 1 ; 刘明典 2 ; 汪登强 2 ; 董微微 2 ; 吕浩 2 ; 陈大庆 2 ; 李云 3 ;

作者机构: 1.西南大学动物科技学院;中国水产科学研究院长江水产研究所;西南大学生命科学学院

2.;西南大学动物科技学院;中国水产科学研究院长江水产研究所;西南大学生命科学学院

3.;西南大学动物科技学院;中国水产科学研究院长江水产研究所;西南大学生命科学学院;

关键词: 鲢(Hypophthalmichthys molitrix);线粒体;遗传多样性;Cyt b;D-loop

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 20-25+68

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 鲢(Hypophthalmichthys molitrix)是我国重要的淡水经济鱼类,长江是其重要的种质资源库。为了研究长江中上游鲢群体遗传多样性现状,比较中上游群体的遗传分化,本研究采用线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b基因(Cyt b)和控制区(D-loop)序列分析了长江中上游鲢群体遗传多样性及遗传分化状况,为鲢资源的保护和开发提供科学依据。采集了长江中上游江津(JJ)、宜昌(YC)、嘉鱼(JY)、黄冈(HG)等4个鲢群体共151尾样本。结果表明:135条Cyt b序列共检测出53个多态位点和19种单倍型,150条D-loop序列共检测出94个多态位点和48种单倍型,平均单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.693、0.00748和0.902、0.01557,2个标记数据均显示上游群体遗传多样性较中游群体高;群体间的分化指数(FST)和基因流(Nm)均表明长江上游(JJ)和中游(YC、JY、HG)地理群体间存在显著遗传分化。基于单倍型构建的NJ系统发育树及单倍型中值连接网络分析图显示,长江中上游鲢群体可划分为两个谱系,其中一个谱系主要源自上游群体。

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