文献类型： 中文期刊

作者： 李苓 ¹ ; 张冬杰 ² ; 汪亮 ² ; 王鑫鑫 ¹ ; 曹越 ¹ ; 刘娣 ¹ ;

作者机构： 1.东北农业大学动物科技学院

2.黑龙江省农业科学院畜牧研究所

关键词： 民猪;FoxN1基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2016 年 43 卷 04 期

页码： 928-933

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在对民猪FoxN1基因的结构和功能进行初步探索。利用常规PCR技术对民猪FoxN1基因进行克隆,利用生物信息学手段对所获得FoxN1基因完整编码区序列进行分析,对民猪和大白猪的FoxN1基因序列进行比对,并构建分子进化树。结果显示,民猪FoxN1基因完整编码区长1 941bp,编码646个氨基酸,分子质量为68.64ku,理论等电点为5.81。FoxN1蛋白位于细胞核内,不存在信号肽,不是分泌性蛋白,不存在跨膜区,在第269—347氨基酸处有1个叉头结构域,该蛋白在不同的物种间有高度的保守性。克隆发现了3种转录剪切变异体,与变异体1相比,变异体2在第124—387核苷酸位置处发生缺失,变异体3在581—582处发生GCA插入。民猪与大白猪的FoxN1基因序列相比,存在4个突变位点,其中3个是同义突变,1个是错义突变,导致第108位的氨基酸发生了改变。由分子进化树得知,民猪与偶蹄目动物亲缘关系较近。上述结果表明FoxN1基因结构复杂,对其生物信息特性的探究将为进一步揭示民猪FoxN1基因的功能提供依据。