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基于SSR标记不同距离聚类与抽样方法构建辣椒核心种质库

文献类型： 中文期刊

作者： 何建文 1 ; 韩世玉 1 ;

作者机构： 1.贵州省辣椒研究所

关键词： 辣椒;SSR标记;核心种质库

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2015 年 28 卷 05 期

页码： 2199-2204

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为最大限度地保存辣椒原群体的遗传变异度,利用SSR分子标记技术比较不同距离聚类和抽样方法构建辣椒的核心种质库。结果表明:在马氏距离下,4种抽样比例中当抽样比例达20%和25%时均值差异百分率MD%为0;在相同欧氏距离下,4种抽样比例中,以10%、15%和20%比例进行抽样均值差异百分率(MD%)为0。在采用的8种聚类方法中,只有最短距离法均值差异百分率(MD%)为最小值0。不同取样法,变异系数变化率为多次聚类偏离度取样法(107.06%)>多次聚类随机取样法(101.18%)>多次聚类优先取样法(59.57%)。从97份参试材料中筛选出沿河2、德江5、石阡3、台江1、仁怀4、务川2、遵义5、河南1和海南1共计9份核心种质,均匀分布于不同的类群中。结论:在欧氏距离下,按10%比例进行抽样,用多次聚类随机取样法取样、最短遗传距离法进行聚类分析为构建辣椒核心种质库的最佳选择。

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