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甘蓝型油菜FAF基因家族鉴定并挖掘分枝形成相关成员

文献类型： 中文期刊

作者： 蒋先润 1 ; 罗桂林 1 ; 梁峰豪 2 ; 黄莎 2 ; 肖华贵 2 ; 张超 2 ; 代文东 3 ;

作者机构： 1.贵州大学农学院

2.贵州省农业科学院贵州省油料研究所

3.贵州省农业科学院贵州省油菜研究所

关键词： 甘蓝型油菜;FAF家族;全基因组鉴定;分枝

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2022 年 30 卷 005 期

页码： 847-860

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： FAF基因家族是植物界特有的转录因子之一,具有调节分生组织大小的作用.为研究甘蓝型油菜(Brassica napus)中FAF基因对分枝形成的影响,本研究对甘蓝型油菜FAF家族成员进行了全基因组鉴定和生物信息学分析;以3个多分枝材料和3个少分枝材料为研究对象,提取不同生育期组织部位的总RNA,利用qPCR对BnFAF基因进行了表达模式分析.结果显示,甘蓝型油菜中共有17个BnFAF基因,分布在13条染色体上;基于氨基酸序列的相似度,参考拟南芥(Arabidopsis)FAF基因将BnFAF基因分为Ⅰ~Ⅳ共4个亚家族;基因结构、蛋白结构鉴定表明Ⅳ家族成员的分化较大,而其余亚家族内成员相对保守.qPCR分析发现,BnFAF4-4和BnFAF4-7的表达模式一致,且在多分枝材料薹期茎、上部腋芽和中部腋芽中的相对表达量显著高于少分枝材料,推测这些基因可能影响分枝的形成.本研究为进一步利用FAF基因改良甘蓝型油菜分枝性状提供了理论指导.

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