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民猪低温胁迫的基因表达谱分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨月莹 1 ; 刘娣 2 ; 丁常宏 3 ; 祁雪莲 1 ;

作者机构： 1.东北农业大学理学院

2.黑龙江省农业科学院

3.黑龙江中医药大学

关键词： 基因表达谱;目标优化;低温胁迫;特征选择

期刊名称： 江西农业大学学报

ISSN： 1000-2286

年卷期： 2013 年 35 卷 04 期

页码： 807-812

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 随着基因芯片在基因的发现与识别等研究方面的应用,高通量并行识别特征基因成为表达谱分析的重要工作之一。地方猪种民猪在抗寒性方面表现出较好的生物特征,提出的目标优化方法在识别民猪抗寒性状相关基因方面效果较好。通过制备常温状态和低温状态两类样本的基因芯片,获得了民猪低温胁迫的表达谱数据,通过目标优化算法多次迭代筛选得到的特征基因集合,对于不同的特征基因集合的分析,最终确定民猪抗寒性状相关基因,注释在生物学数据库中获得了相应的基因功能。目标优化算法泛化性能较好,能够同步进行特征基因的选择和样本分类两过程。

  • 相关文献

[1]目标规划模型在猪抗寒性状相关基因筛选中的应用. 杨月莹,刘娣,丁常宏,祁雪莲. 2013

[2]猪肌肉组织表达序列标签(ESTs)的分析. 王秀利,仇雪梅,刘娣. 2007

[3]欧美山杨杂种插穗不定根2个发育时期基因表达谱分析. 闫绍鹏,尚艳茹,冷淑娇,杨瑞华,王秋玉. 2015

[4]大豆过氧化物酶Ⅲ的生物信息学分析. 魏崃,张丽,王伟威,于志远,喻德跃. 2015

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