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吉富罗非鱼两种生长激素受体基因的分离及与增重相关的SNPs位点

文献类型: 中文期刊

作者: 阮瑞霞 1 ; 俞菊华 1 ; 李红霞 2 ; 李建林 2 ; 唐永凯 2 ; 魏可鹏 1 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室

关键词: 吉富罗非鱼;生长激素受体;单核苷酸多态性;增重;组织表达

期刊名称: 动物学杂志

ISSN: 0250-3263

年卷期: 2011 年 46 卷 03 期

页码: 37-46

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 实验分离了吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)两种生长激素受体基因GHR1和GHR2的全长cDNA以及GHR1阅读框中外显子2~9、GHR2阅读框外显子2~8的DNA序列。在GHR1和GHR2分别找到6个和16个SNPs位点,其中只有2个位点在外显子部分。使用PCR-RFLP方法检测了5个家系共120尾吉富罗非鱼在8个SNPs(GHR1内含子3_A612G、内含子3_A989T、内含子7_A599C;GHR2内含子3_C330T、内含子3_A645G、内含子3_G687T、内含子3_A967G、内含子7_C107T)的基因型。不同基因型与雌、雄吉富罗非鱼增重的相关性分析显示,GHR1内含子3_A612G及内含子3_A989T与雄鱼增重极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,杂合型个体增重最大,在雌鱼群体中有类似趋势,但差异不显著;内含子7_A599C与雄鱼、雌鱼增重分别呈现极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,CC型雌雄鱼增重均大于AA型;GHR2上只有内含子3_G687T与雌鱼增重显著相关(P<0.05),GT型个体增重显著大于GG型。检测了60个家系共356尾吉富罗非鱼在3_A612G、3_A989T、7_A599C和3_G687T的基因型与增重性状的相关性,结果具有相同趋势,因样本少、遗传背景多样,导致差异性显著降低。实时定量PCR结果显示,GHR1在雄鱼肝的表达量是雌鱼的1.36倍;除肾外,GHR2在雄鱼各组织的表达量均低于雌鱼,这部分解释了GHR1和GHR2基因上SNP位点对雌、雄吉富罗非鱼增重的不同影响。此外,GHR1、GHR2对生长影响程度的不同,导致只在GHR2上找到1个SNP位点对增重有影响。

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